五種電泳技術的比較 SDSPAGE
名詞解釋:
相對遷移率(Rf)
問答題:
1.簡述SDS-PAGE的基本原理。 2.影響SDS電泳的關鍵因素有哪些? AGE
? 名詞解釋 1.遷移率 2.電滲 3.電泳
? 問答題
1.影響電泳遷移率的因素有哪些?
2.試述瓊脂糖凝膠電泳分離脂蛋白的原理。 CAME
1.CAME的基本原理是什么?
2.CAME分離血清蛋白電泳時應注意哪些問題? PAGE 名詞解釋
1.凝膠總濃度 2.交聯度 問答題
1.與CAME相比,PAGE有哪些特點。 2.試比較CAME與PAGE操作的區別。 3.簡述不連續PAGE的原理。
1.瓊脂糖凝膠電泳Agarose Gel Electrophoresis
? Gel Electrophoresis :由瓊脂、瓊脂糖、淀粉膠及聚丙烯酰胺等物質作支持體的電泳。 ? 特點(characteristic):
1.可以制成非常均勻的凝膠,帶電質點在凝膠的孔中泳動。 2. 電泳操作方法簡便,電泳速度快。
3. 分辨率高,重復性好,電泳圖譜清晰。 4. 適用于生化,免疫等定性定量測定。 (一)優點(advantage)
1.因不含硫酸根和羧基,幾乎消除了瓊脂的電滲。
2.對蛋白質吸附極微,故無拖尾現象。
3.凝膠結構均勻,孔徑較大,可用來分離酶的復合物、核酸、病毒 等大分子物質。 4.透明度較好,可直接或干燥成薄膜后進行染色。
5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量測定。 6.有熱可逆性。
(二)缺點(disadvantage)
1.機械強度差,易破碎,濃度不能太低。2.易被細菌污染,不易保存,臨用前配制。
3.瓊脂糖支持層上的區帶易于擴散,電泳后必須立即固定染色。 4.與PAGE相比,分子篩(molecular sieve)作用小,區帶少。 應用
1. 適用于大分子的核酸、核蛋白等的分離、鑒定及純化 2. 臨床生化檢驗中常用于LDH、CK等同工酶的分離與檢測 3. 為不同類型的高脂蛋白血癥、冠心病等提供生化指標 影響遷移的因素
? the size of the molecule
? conformation of the molecule ? the agarose concentration of a gel ? Voltage
百分濃度和分辨率限制
? Most agarose gels are made with between 0.7% (good separation or resolution of large
5–10kb DNA fragments) and 2% (good resolution for small 0.2–1kb fragments) agarose dissolved in electrophoresis buffer.
? Up to 3% can be used for separating very tiny fragments but a vertical polyacrylamide
gel 聚丙烯酰胺is more appropriate in this case.
? Low percentage gels are very weak and may break when you try to lift them. High
percentage gels are often brittle and do not set evenly. 1% gels are common for many applications.
瓊脂糖凝膠分離血漿脂蛋白
原理: 血清脂蛋白經飽和蘇丹黑B預染后,以瓊脂糖凝膠為支持介質,在pH8.6巴比妥緩沖液中電泳,根據各脂蛋白的組成、大小、形狀分離成不同區帶。
? pH 8.6 > pI ,各種脂蛋白均帶負電,電泳時由負極到正極;VLDL為圓形,受阻力小,LDL形態不規則,受阻力大,所以VLDL跑在前。 加樣槽在負極,由負極到正極分別是CMLDLVLDLHDL
2.醋酸纖維薄膜電泳Cellulose acetate membrane electrophoresis,CAME 特點:低吸附作用,低電滲作用,樣本用量少,親水性 1.Low sorption 2.Low electroosmosis 3.Small sample 4.Hydrophilic 電泳圖譜不齊
①點樣時血清點加不均勻 ②薄膜局部干燥
③電泳時供給薄膜的液量不均勻或過少 ④緩沖液變質
⑤電泳時薄膜位置不正,與電流方向不平行 電泳圖譜分理不清
①點樣時血清點加不均勻
②薄膜局部干燥
③電泳時供給薄膜的液量不均勻或過少 ④緩沖液變質 ⑤電泳時薄膜位置不正,與電流方向不平行 電泳速度慢
? 電流過低
? 供給薄膜的液量不足 ? 緩沖液離子強度過高
? 薄膜中雜質
白蛋白區帶中間部分不著色,染色不足 染色時間不夠、點樣過多 γ球蛋白向反方向移動
電滲現象,可提高緩沖液液面或加大電流量以改進 區帶一邊長一邊短呈扭曲現象
薄膜未緊壓在
電泳槽的濾紙橋上,使薄膜接觸不良而增大了電阻。
區帶拖尾或區帶過于緊密
緩沖液離子強度<0.05可出現區帶拖尾;離子強度>0.075可出現區帶過于緊密。 血清蛋白質醋酸纖維薄膜電泳Separate serum protein in cellulose acetate membrane electrophoresis
[原理] CAME是以醋纖膜(CAM)作支持物的一種區帶電泳技術。
將血清樣品點樣于醋纖膜上,在pH8.6的緩沖液中電泳時,血清蛋白質均帶負電荷移向正極。由于血清中各蛋白組分等電點不同而致表面凈電荷量不等,加之分子大小和形狀各異,因而電泳遷移率不同,彼此得以分離。加樣:用加樣器蘸取血清約5ul,垂直印在CAM粗糙面,點樣區距離邊緣約1.5cm,電泳時點樣面朝下。加上槽蓋平衡5分鐘后再通電。電壓10~15V/cm膜總寬。電泳40~60分鐘,泳動距離約達3.5~4cm時即可斷電。 由負極到正極可分為五條條帶 γ β α2 α1 白蛋白 #p#分頁標題#e#
3.聚丙烯酰胺凝膠電泳Polyacrylamide Gel Electrophoresis PAGE
PAG是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)單體和N,N’-亞甲雙丙烯酰胺(N,N,N’,N’-methylene bisacrylamide,Bis)交聯劑通過自由基( free radicals)聚合而成的一種多孔三維網狀結構。
過硫酸胺[(NH4)2S2O8](Ammonium persulfate,AP)作為催化劑,四甲基乙二胺(-N,N,N',N'-tetramethylethylene diamine , TEMED)為加速劑。 ¬TEMED量多少都會影響催化作用,須在堿性條件下聚合 -分子氧存在,聚合不完全,須去除分子氧,隔絕氧
®升高溫度能提高聚合,降低溫度能延遲聚合
PAG孔徑的大小主要由Acr和Bis這兩種單體的濃度決定。可以根據要分離物質分子的大小,選擇合適的單體濃度。
Acr/Bis:20~40 完全透明且有彈性; <10 很脆,易碎,不透明; >100 糊狀不成形,易破碎 常用的標準凝膠是指濃度為7.5%的凝膠 交聯度C——Bis占單體與交聯劑總量的百分比。 C=b/(a+b)×100%
電極槽緩沖液通常為pH8.3 Tris-甘氨酸緩沖液 分離原理 1. 濃縮效應 1)凝膠層的不連續性
兩層凝膠T與C不同?孔徑不同
濃縮膠孔徑大,分離膠孔徑小,蛋白質在大孔徑濃縮膠中移動,受阻力小,移動速度快。 2)緩沖液離子成分的不連續性
甘氨酸(pI=6.0)在pH8.3帶負電,朝正極移動,進入濃縮膠(pH6.7),甘氨酸解離度(?)很小,有效遷移率(M ?)很低,移動速度較慢,稱為慢離子。 HCl 是強電解質,?=1,Cl-有效遷移率大,移動速度快,稱快離子。 蛋白質(pI<6.0)帶負電荷,有效遷移率介于兩者之間。 3)pH值的不連續性
為了控制慢離子的解離度,從而控制其有效遷移率,必須使濃縮膠與分離膠之間pH值有所區別。
3.分子篩效應與電荷效應
進入分離膠后,Gly-
成為快離子
分離膠只有電荷效應和分子篩效應,根據各蛋白質所帶電荷不同、分子大小不同而分離
PAGE特點
1.具有分子篩效應,分辨率高
2.樣品不易擴散,用量少,靈敏度可達10-6g
3.化學性質穩定,分子結構中富含酰胺基具有穩定的親水基團 4.凝膠不帶電荷,消除了電滲現象
5.機械強度好,有彈性,在一定濃度范圍內無色透明
6.網孔可調節 4.SDSPAGE
十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS,also called lauryl sulfate) 是一種陰離子去污劑(anionic detergent )。
• 作用:破壞蛋白質分子之間以及其他物質分子之間的非共價鍵,使蛋白質變性
(denature)而改變原有的構象; • 保證蛋白質分子與SDS充分結合而形成帶負電荷的蛋白質-SDS復合物。 原理
(一)蛋白質分子的解聚
樣品介質和聚丙烯酰胺中加入離子去污劑和強還原劑后,蛋白質亞基的電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大小(molecular mass of polypeptides ),而電荷因素可以被忽略。 1、SDS
陰離子去污劑(anionic detergent ) 變性劑(denaturant) 助溶性試劑
斷裂分子內和分子間的氫鍵(hydrogen bond) 分子去折疊
破壞蛋白質分子的二級和三級結構 2、強還原劑
巰基乙醇(β-mercaptoethanal)
二硫蘇糖醇(dithiothreitol,DTT)使半胱氨酸殘基之間的二硫鍵(disulfide bond)斷裂。
? SDS和還原劑的作用:
(1)分子被解聚
(2)氨基酸側鏈與SDS充分結合形成帶負
電荷的蛋白質-SDS膠束。
(3)蛋白質-SDS膠束所帶的負電荷大大超 過了蛋白質分子原有的電荷量,消除 了不同分子之間原有的電荷差異。
去污劑的選擇
無離子去污劑:Lubro W;Brij35, Tween Triton
陽離子去污劑:cetyltrimethyl ammonium bromide (CTAB) cetylpyyridinium (CPC) 陰離子去污劑:SDS deoxycholate
電泳過程中的不正常現象 (1)“微笑”現象
指示劑前沿呈現兩邊向上的曲線形,說明凝膠的不均勻冷卻,中間部分冷卻不好。 2)“皺眉”現象
由于垂直
電泳槽的裝置不合適引起的,特別是當凝膠和玻璃板組成的“三明治”底部有氣泡或靠近隔片的凝膠聚合不完全。 (3)“拖尾”現象
樣品溶解不佳引起。 (4)“紋理”現象
由于樣品中的不溶顆粒引起的。 (5)偏斜現象
電極放置不平行引起或加樣位置偏斜而引起 (6)帶太寬 #p#分頁標題#e#
加樣量太多或加樣孔泄漏引起 分子量測定
1、相對遷移率(relative mobility ,Rf)
Rf即用每個帶的遷移距離除以溴酚藍前沿的遷移距離得到的。 測量位置應在蛋白帶的中央。
2、作圖
以已知蛋白質分子量的常用對數值為縱坐標,Rf為橫坐標繪圖 3、通過測定未知蛋白質的Rf值,便可在標 準曲線上讀出他的分子量
5.等電聚焦電泳Isoelectric Focusing Electrophoresis, IEFE
等電聚焦電泳(IEFE)是一種利用具有pH梯度的支持介質分離等點電(PI)不同的蛋白質的電泳技術。
原理: 在電泳介質中加入載體兩性電解質,通電后,兩性電解質會逐漸形成一個由正極到負極遞增的pH梯度,在此體系中,不同的蛋白質移動并聚焦于與其等電點相當的pH位置。
理想的載體兩性電解質應具備的特征 ①化學性質穩定; ②分子量要小
→以便與被分離大分子物質分離;
③各成分的pI彼此接近,并在其pI值附近有良好的緩沖能力 →梯度穩定;
④兩性電解質載體的數目要足夠多
→梯度平滑 ;
⑤對280nm的紫外光沒有或僅有很低的吸光度 →不影響測定。 優點:
? 分辨率高(可達0.01pH單位);
? 靈敏度高(**低檢出量達0.1ng); ? 電泳區帶狹窄;
? 重復性好。 缺點:
? 要求用無鹽溶液,而在無鹽溶液中蛋白質可能發生沉淀; ? 由于樣品中的成分會停留在其pI,不適用在pI不溶的蛋白質。 IEFE應用
? 1.分析分離制備蛋白質、多肽
? ①區分人血清蛋白
? ②測出異常免疫球蛋白 ? ③基因分型
? ④csf中寡克隆區帶的檢測 ? 2.測定pI可鑒定蛋白質、多肽 ? 3.雙相電泳中,IEFE作為**相